RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZRM9 215 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QT63 122 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNJ2BPP57105 145 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 C5orf38Q86SI9 138 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM17AQ99595 171 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IAPPP10997 89 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGEF1-202ENST00000380828 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF843Q8N446 348 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf51A8MQB3 221 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CD70P32970 193 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD7P58549 80 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SERF2P84101 59 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CFHR3Q02985 330 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 FGFBP3Q8TAT2 258 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 AKAP9Q99996 3911 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS20P59510 1910 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00205P59089 165 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CCKP06307 115 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CA6P23280 308 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BMM0 161 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2WQ96B02 151 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 PAXXQ9BUH6 204 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A096LNJ9 63 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZS52 159 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6P435 159 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WZ39 114 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM223BA6NKX1 122 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MUN3 132 aa5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-202ENST00000380828 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-202ENST00000380828 CADP27708 2225 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CD59P13987 128 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 RHOHQ15669 191 aa5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-202ENST00000380828 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.16□□□□□ -1.58
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RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WVE0 104 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JNJ9 132 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 PDPNQ86YL7 162 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL26Q96S19 204 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 Q9UFV3 132 aa5.15□□□□□ -1.58
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RABGEF1-202ENST00000380828 H7BZZ5 65 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 MGST2Q99735 147 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF492Q9P255 531 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 CREBBPQ92793 2442 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 PRNTQ86SH4 94 aa5.15□□□□□ -1.59
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RABGEF1-202ENST00000380828 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2D1P51668 147 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf197Q8N268 126 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N7P7 452 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-202ENST00000380828 E7EUB6 86 aa5.14□□□□□ -1.59
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