RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESPL1Q14674 2120 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 A2MP01023 1474 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROK2Q9HC23 129 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL7A1Q02388 2944 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANK1P16157 1881 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPDO75976 1380 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCA4P78363 2273 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0QZK8 103 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 UQCRQO14949 82 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL7P13232 177 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CKS2P33552 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPHQ9H3R5 247 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMPXQ9UHP9 88 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANK2Q01484 3957 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDM6BO15054 1643 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GV72 72 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCKP06307 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNA21P01568 189 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPC1LP0DKB6 136 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADCYAP1P18509 176 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDC4P31431 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM128Q5BJH2 165 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC115Q96NT0 180 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 V9GYQ6 96 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRGP23470 1445 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCRIP1C9JLW8 97 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINK1P00995 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 FABP1P07148 127 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q5BKY6 102 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD13Q5VXD3 122 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2H2O95918 312 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCBD1P61457 104 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSPHP78330 225 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSCR8Q96T75 97 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDA1Q9BW61 102 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CADP27708 2225 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR97A6NE52 1622 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9JAW5 83 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCRAP04437 139 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYYP10082 97 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100A5P33763 92 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLGLB1Q02325 96 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED13LQ71F56 2210 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOC1P02654 83 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMX2Q04743 252 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM141Q96I45 108 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms