RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HDGFP51858 240 aaKnown RBP-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL18Q14116 193 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BEX5Q5H9J7 111 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCEAL5Q5H9L2 206 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM27BQ5VT28 67 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5H6Q8NGV6 325 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLGRKTQ9HBL7 147 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUFT1Q9NNX1 390 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERG28Q9UKR5 140 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARL5AQ9Y689 179 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa-5.25□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GU69 56 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRDCB7Z8K6 153 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0R2Z0 102 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFB1O75438 58 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CST3P01034 146 aaPredicted RBP-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCKP06307 115 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMIM6P0DI80 62 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGDIBP52566 201 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAB8AP61006 207 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RANP62826 216 aaKnown RBP-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST1H3AP68431 136 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARF5P84085 180 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STX4Q12846 297 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMD5Q16401 504 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMG4Q5JS54 123 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPANXN5Q5MJ07 72 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADALQ6DHV7 355 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C3orf33Q6P1S2 294 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEX26Q7Z412 305 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HDDC2Q7Z4H3 204 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUSC5Q8IXB3 177 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COX7B2Q8TF08 81 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTH2Q96A98 100 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LXNQ9BS40 222 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOL6Q9BWW8 343 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00597Q9H2U6 94 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHOJQ9H4E5 214 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VCPKMTQ9H867 229 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFT140Q96RY7 1462 aa-5.26□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNAPINO95295 136 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBP1P09455 135 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCNB1P14635 433 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSTM2P28161 218 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASP7P55210 303 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COX17Q14061 63 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIKESHIQ53FT3 197 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf185Q5T7R7 199 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TANGO2Q6ICL3 276 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMA8Q8TAA3 256 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM18Q96B42 140 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPCDCQ96CD2 204 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FMC1Q96HJ9 113 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 P2RY13Q9BPV8 354 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIEN1Q9BRT3 115 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM147Q9BVK8 224 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q9Y3F1 56 aa-5.27□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LEPROTL1O95214 131 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTRP02766 147 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAP2AP10114 183 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED21Q13503 144 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TOMM20Q15388 145 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBE2V2Q15819 145 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CBR4Q8N4T8 237 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MLKLQ8NB16 471 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LGALS14Q8TCE9 139 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HMGB4Q8WW32 186 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCN9Q8WX39 176 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GINS3Q9BRX5 216 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIS12Q9H081 205 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEMTQ9UBM1 199 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAT8BQ9UHF3 227 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAP2CQ9Y3L5 183 aa-5.28□□□□□ -3.25
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP5Q13017 1502 aa-5.28□□□□□ -3.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF27Q86VH2 1401 aa-5.29□□□□□ -3.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-5.29□□□□□ -3.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A4D1N5 150 aa-5.29□□□□□ -3.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H3BMG7 143 aa-5.29□□□□□ -3.26
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYTH3O43739 400 aa-5.29□□□□□ -3.26
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