RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 HSPG2P98160 4391 aa14.48□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 A0A096LPF7 62 aa14.48□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 PAX4O43316 350 aa14.48□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 Q6ZNX1 250 aa14.48□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 C6orf223Q8N319 242 aa14.48□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.48□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 IGLV2-11P01706 119 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 SLAQ13239 276 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 PRNTQ86SH4 94 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 RASL10AQ92737 203 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 KCNS1Q96KK3 526 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 C8orf49Q96NF6 230 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 PRO0255Q9UI72 69 aa14.47□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 IFNA7P01567 189 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 TYMSP04818 313 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 UBE2G2P60604 165 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 FHL2Q14192 279 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.46□□□□□ -0.09
CITED1-201ENST00000246139 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 GCGP01275 180 aa14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 CRYBA4P53673 196 aa14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.45□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 SFTA3P0C7M3 94 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ZNF345Q14585 488 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ZFP69Q49AA0 526 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 SMUG1Q53HV7 270 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ZNF479Q96JC4 524 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 LINC00479Q96M42 142 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 UPK3BQ9BT76 320 aa14.44□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 FAM74A7A6NL05 159 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 HMSDA8MTL9 139 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 M0R2P5 195 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 TNP2Q05952 138 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 TTC32Q5I0X7 151 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.43□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.42□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 A0A0D9SG52 128 aa14.41□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 PEX7O00628 323 aa14.41□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 PPT1P50897 306 aa14.41□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ZNF575Q86XF7 245 aa14.41□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.41□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 STOML3Q8TAV4 291 aa14.41□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 FHITP49789 147 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 AKAP14Q86UN6 197 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.4□□□□□ -0.1
CITED1-201ENST00000246139 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.39□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 BCL2L11O43521 198 aa14.39□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 SEC11BP0C7V7 166 aa14.39□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 C9JCJ5 164 aa14.38□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 ZNF876PQ49A33 203 aa14.37□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.37□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.37□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 A0A1W2PPQ1 181 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 UMAD1C9J7I0 102 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 K7EQD1 137 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 ORM1P02763 201 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 GYPEP15421 78 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 CST9LP1Q5W188 147 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 Q86TA4 180 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.36□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.35□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 PFDN1O60925 122 aa14.35□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 SRIP30626 198 aa14.35□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.35□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 C9orf85Q96MD7 179 aa14.35□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 SIVA1O15304 175 aa14.34□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 NXPH4O95158 308 aa14.34□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 TMUB2Q71RG4 321 aa14.34□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.34□□□□□ -0.11
CITED1-201ENST00000246139 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.33□□□□□ -0.12
CITED1-201ENST00000246139 A0A1B0GV50 99 aa14.33□□□□□ -0.12
CITED1-201ENST00000246139 C16orf90A8MZG2 172 aa14.33□□□□□ -0.12
CITED1-201ENST00000246139 PAGE4O60829 102 aa14.33□□□□□ -0.12
CITED1-201ENST00000246139 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.4 ms