RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF415Q09FC8 603 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 THAP6Q8TBB0 222 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 OR51M1Q9H341 326 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WTM6 91 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 NHLH2Q02577 135 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 Q8TAT8 98 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 FXYD5Q96DB9 178 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 OR5C1Q8NGR4 320 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 LY96Q9Y6Y9 160 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 E5RGE8 158 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 OR10J4P0C629 311 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 DNAH10OSP0CZ25 163 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 PHYHIPLQ96FC7 376 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 PAXXQ9BUH6 204 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 MDFICQ9P1T7 246 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 K7EP13 123 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 K7EQD1 137 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF266Q14584 549 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 MUC21Q5SSG8 566 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRF-216ENST00000617451 RBAKDNA6NC62 111 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 SFTA3P0C7M3 94 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP10-1P60331 282 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR10G4Q8NGN3 311 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 RASL10AQ92737 203 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF479Q96JC4 524 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 MYCBP2O75592 4640 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 IFNA5P01569 189 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 SRIP30626 198 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 WFDC10BQ8IUB3 73 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A31Q9H0C2 315 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 CSN1S1P47710 185 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC32Q9BV29 185 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 KCNIP2Q9NS61 270 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 GYPEP15421 78 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 EVI2AP22794 236 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 RANP62826 216 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 Q6AWC8 147 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 SPXQ9BT56 116 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR7C2O60412 319 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 ORM1P02763 201 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 Q5VSD8 79 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 FRZBQ92765 325 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR5AC2Q9NZP5 309 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRF-216ENST00000617451 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 SIX6O95475 246 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 DIRC3C9JPN6 131 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 H0YIZ8 118 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 NMES1Q9C002 83 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 C9JCJ5 164 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 TDRG1Q3Y452 100 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 CRYGDP07320 174 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 GCSHP23434 173 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 TMED6Q8WW62 240 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf126Q8N4M7 172 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 OR4C5Q8NGB2 326 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 ASAH1Q13510 395 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 NAGKQ9UJ70 344 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 M0R2P5 195 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 GNRH2O43555 120 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 KHDC3LQ587J8 217 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 FFAR4Q5NUL3 377 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 HYLS1Q96M11 299 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 ATP5SQ99766 215 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 TIRAPP58753 221 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 DNAH8Q96JB1 4490 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R45P59539 299 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 OTORQ9NRC9 128 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 LRCOL1A6NCL2 159 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 PGPA6NDG6 321 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-216ENST00000617451 CMTM2Q8TAZ6 248 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.7 ms