RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CRISP2P16562 243 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 DAD1P61803 113 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR9Q5T870 116 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 STOML3Q8TAV4 291 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C16orf74Q96GX8 76 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 EPDR1Q9UM22 224 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PRE2 83 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CBY3A6NI87 242 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SNURFLB1AK76 121 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 UMAD1C9J7I0 102 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 K7EQM0 130 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS13O14921 159 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TCRAP04437 139 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP69Q49AA0 526 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC21Q5SSG8 566 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CST9LP1Q5W188 147 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PRNTQ86SH4 94 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TVP23CQ96ET8 276 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00479Q96M42 142 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TREM1Q9NP99 234 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PSG8Q9UQ74 426 aa4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.84□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE6AA0A183 80 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM74A7A6NL05 159 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 LYRM9A8MSI8 78 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GGTLC3B5MD39 225 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 F6UZH7 168 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 PAGE4O60829 102 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 LY6G6CO95867 125 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC51BQ86UW2 128 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 C8orf49Q96NF6 230 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 APLNQ9ULZ1 77 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.83□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TENM2Q9NT68 2774 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE12BA1L429 117 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GNRH2O43555 120 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE7O76087 117 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV2-11P01706 119 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE12FP0CL80 117 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE12GP0CL81 117 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE12IP0CL82 117 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5G3P48201 142 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 SULT1A2P50226 295 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL20P78556 96 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ATG101Q9BSB4 218 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 NAGKQ9UJ70 344 aa4.82□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 F5H768 121 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 PEX7O00628 323 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 GCGP01275 180 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5G1P05496 136 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 PPT1P50897 306 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB5CP51148 216 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5I1Q13606 314 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 SMUG1Q53HV7 270 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6AWC8 147 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZTI0 123 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.81□□□□□ -1.64
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.3 ms