RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565362.5

PDXDC1-211, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-211ENST00000565362 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.37□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 CRYBA4P53673 196 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 SLAQ13239 276 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 FHL2Q14192 279 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF266Q14584 549 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ATP5SQ99766 215 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 PRO0255Q9UI72 69 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.36□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 A6NHS1 94 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 DIRC3C9JPN6 131 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 SIVA1O15304 175 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 PAX4O43316 350 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 OR7C2O60412 319 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 MPC2O95563 127 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 CSN1S1P47710 185 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 LINC00315P59091 139 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 KRTAP10-2P60368 255 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 RANP62826 216 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF415Q09FC8 603 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 Q6AWC8 147 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 Q8TAT8 98 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 TMED6Q8WW62 240 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 HSPB11Q9Y547 144 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.35□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-53P01767 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 RASL10AQ92737 203 aa7.34□□□□□ -1.23
PDXDC1-211ENST00000565362 NXPH4O95158 308 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 PET100P0DJ07 73 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TAS2R45P59539 299 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TDRG1Q3Y452 100 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 KHDC3LQ587J8 217 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 MUC21Q5SSG8 566 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 Q8N1X5 172 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 C8orf49Q96NF6 230 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SPXQ9BT56 116 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 MDFICQ9P1T7 246 aa7.33□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 IFNA5P01569 189 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 ZNF479Q96JC4 524 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 WFDC1Q9HC57 220 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 OTORQ9NRC9 128 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.32□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 PGPA6NDG6 321 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 K7EQD1 137 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SSNA1O43805 119 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SFTA3P0C7M3 94 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 HERC1Q15751 4861 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 MBD2Q9UBB5 411 aa7.31□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 K7EP13 123 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 DEFA1P59665 94 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 DEFA3P59666 94 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TVP23CQ96ET8 276 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 HYLS1Q96M11 299 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.3□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 GNRH2O43555 120 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 ORM1P02763 201 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 GYPEP15421 78 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SRIP30626 198 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 NFE4Q86UQ8 179 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.29□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 A0A1W2PPV4 95 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 M0R2P5 195 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 TYMSP04818 313 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 RAB2AP61019 212 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.28□□□□□ -1.24
PDXDC1-211ENST00000565362 SUN5Q8TC36 379 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms