RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 ARPC5O15511 151 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 MBP02144 154 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 HOXA5P20719 270 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 ZNF726P1Q15940 193 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 TVP23CQ96ET8 276 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 TMED6Q8WW62 240 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 RGS13O14921 159 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 TCL1AP56279 114 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 Q6AWC8 147 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-222ENST00000550996 GGTLC3B5MD39 225 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 MUC21Q5SSG8 566 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 M0R2N4 97 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 SPINK4O60575 86 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 NUDT3O95989 172 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 OR5I1Q13606 314 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 RNF212Q495C1 297 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 PKHD1P08F94 4074 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 CXorf1O96002 111 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 SGK494Q96LW2 274 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 C18orf15Q96N68 181 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 NACAE9PAV3 2078 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 F6UZH7 168 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TAAR5O14804 337 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TCRAP04437 139 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 MDFICQ9P1T7 246 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 A0A0J9YY99 117 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 IGLV2-11P01706 119 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 Q6ZR54 194 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 MUC4Q99102 2169 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.53□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.53□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.53□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 TREM1Q9NP99 234 aa14.53□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 PKD1P98161 4303 aa14.52□□□□□ -0.08
CS-222ENST00000550996 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 EPDR1Q9UM22 224 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 ZNF415Q09FC8 603 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 ZNF345Q14585 488 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 TDRG1Q3Y452 100 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 C8orf49Q96NF6 230 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 NAGKQ9UJ70 344 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PRE2 83 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 HMSDA8MTL9 139 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 RTL8CO15255 209 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 FHITP49789 147 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 ATG101Q9BSB4 218 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 GNRH2O43555 120 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 IGHV3-53P01767 116 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 UBE2G2P60604 165 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 PSG8Q9UQ74 426 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 H3BNG1 76 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 LINC00479Q96M42 142 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 FAM74A7A6NL05 159 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-222ENST00000550996 TYMSP04818 313 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.6 ms