RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 HTN1P15515 57 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 CD300CQ08708 224 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 ICAM4Q14773 271 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 SSX7Q7RTT5 188 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
NELFE-212ENST00000492539 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 H7BYZ3 331 aa13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 RANP62826 216 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 ZNF726P1Q15940 193 aa13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 STOML3Q8TAV4 291 aa13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 Q9H3A6 140 aa13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 Q9H8V8 135 aa13.83□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.82□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 CXorf1O96002 111 aa13.82□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 SUN5Q8TC36 379 aa13.82□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.82□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 GCHFRP30047 84 aa13.81□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 KIR3DS1Q14943 382 aa13.81□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 ZFP69Q49AA0 526 aa13.81□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 OTORQ9NRC9 128 aa13.81□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 UMAD1C9J7I0 102 aa13.8□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.8□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 ODF3Q96PU9 254 aa13.8□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 UPK3BQ9BT76 320 aa13.8□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.8□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 CSN1S1P47710 185 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 OR5I1Q13606 314 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 TTC32Q5I0X7 151 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 Q8N1X5 172 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.79□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 HOXA5P20719 270 aa13.78□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.78□□□□□ -0.2
NELFE-212ENST00000492539 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PPQ1 181 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 RBAKDNA6NC62 111 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 PGPA6NDG6 321 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 H3BNG1 76 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 CT45A10P0DMU9 189 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 ERCC8Q13216 396 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 SLC51BQ86UW2 128 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 TMED6Q8WW62 240 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 LINC00477Q96M19 166 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.77□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 A0A0J9YY99 117 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 DIRC3C9JPN6 131 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 LEPP41159 167 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 FHITP49789 147 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 ESRGQ1W209 222 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.76□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GAGE12BA1L429 117 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GAGE7O76087 117 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GAGE12FP0CL80 117 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GAGE12GP0CL81 117 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GAGE12IP0CL82 117 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 KRTAP10-2P60368 255 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 VGLL1Q99990 258 aa13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 HERC1Q15751 4861 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 SNURFLB1AK76 121 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.74□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PRE2 83 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 ZNF492Q9P255 531 aa13.73□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GGTLC3B5MD39 225 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 CRISP2P16562 243 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 RAB5CP51148 216 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 ZNF138P52744 262 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.72□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 KLLNB2CW77 178 aa13.71□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 NMBP08949 121 aa13.71□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 GNG5P63218 68 aa13.71□□□□□ -0.21
NELFE-212ENST00000492539 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.4 ms