RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.1□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.1□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 H3BQ15 152 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 TCL1AP56279 114 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 MIC13Q5XKP0 118 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 ATP5SQ99766 215 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.09□□□□□ -0.15
NELFE-210ENST00000491139 EVI2AP22794 236 aa14.08□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 CRYBA4P53673 196 aa14.08□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 GUK1Q16774 197 aa14.08□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 MORN5Q5VZ52 161 aa14.08□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.08□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.07□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 THAP6Q8TBB0 222 aa14.07□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 C8orf49Q96NF6 230 aa14.07□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 CD300CQ08708 224 aa14.06□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 KLLNB2CW77 178 aa14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 ERCC8Q13216 396 aa14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 BTN1A1Q13410 526 aa14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 VGLL1Q99990 258 aa14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 FHL2Q14192 279 aa14.04□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 AQP10Q96PS8 301 aa14.04□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 ZNF253O75346 499 aa14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 SRIP30626 198 aa14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 LINC00477Q96M19 166 aa14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.03□□□□□ -0.16
NELFE-210ENST00000491139 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 M0R3E3 92 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 RGS13O14921 159 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 PSCAO43653 123 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 GPX1P07203 203 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.02□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.01□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 K7EQD1 137 aa14.01□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 CRYGDP07320 174 aa14.01□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.01□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.01□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 PDE6HQ13956 83 aa14□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 ZNF266Q14584 549 aa14□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 NMBP08949 121 aa13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 CRISP2P16562 243 aa13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 PRELID1Q9Y255 219 aa13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.99□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.98□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 GYPEP15421 78 aa13.98□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.98□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.98□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.98□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 G3V3Q6 166 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 ORM1P02763 201 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 ZNF415Q09FC8 603 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 WFDC1Q9HC57 220 aa13.97□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 RNF222A6NCQ9 220 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 Q6ZQT7 251 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 Q8N814 137 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.96□□□□□ -0.17
NELFE-210ENST00000491139 NDUFB4O95168 129 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 C1QBP02746 253 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 SFTA3P0C7M3 94 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 Q5BKY6 102 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 PRR9Q5T870 116 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 ZNF479Q96JC4 524 aa13.95□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.94□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 SYT8Q8NBV8 401 aa13.94□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.94□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NELFE-210ENST00000491139 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms