RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2G2	P60604	165 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1A2	P50226	295 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R60	P59551	318 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	EPDR1	Q9UM22	224 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		12.3	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf71	A4D174	169 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	HTN1	P15515	57 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CRISP2	P16562	243 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CST9LP1	Q5W188	147 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG101	Q9BSB4	218 aa		12.29	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	TCRA	P04437	139 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	EMP1	P54849	157 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		12.28	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GV50	99 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM74A7	A6NL05	159 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	KLLN	B2CW77	178 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	GGTLC3	B5MD39	225 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG5	P63218	68 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF212	Q495C1	297 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		12.27	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	DAD1	P61803	113 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8TAT8	98 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf74	Q96GX8	76 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TREM1	Q9NP99	234 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		12.26	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS13	O14921	159 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PAGE4	O60829	102 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA1	P01562	189 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	BLOC1S1	P78537	153 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		12.25	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX7	O00628	323 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	BTN1A1	Q13410	526 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG8	Q9UQ74	426 aa		12.24	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	CBY3	A6NI87	242 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2G1	P62253	170 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PRNT	Q86SH4	94 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG13	Q9P2W3	67 aa		12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	SNURFL	B1AK76	121 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	FMC1	Q96HJ9	113 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		12.22	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		12.21	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	SMUG1	Q53HV7	270 aa		12.21	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	SGK494	Q96LW2	274 aa		12.21	□□□□□ -0.45
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5G1	P05496	136 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	AZU1	P20160	251 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1C3	P42330	323 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5G3	P48201	142 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6AWC8	147 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		12.2	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		12.19	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		12.18	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	PRM2	P04554	102 aa		12.18	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.18	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNS1	Q96KK3	526 aa		12.18	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		12.17	□□□□□ -0.46
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE6D	O43924	150 aa		12.17	□□□□□ -0.46

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