RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484658.1

RAB3GAP2-208, Transcript of RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2, human

TSL 4

Gene RAB3GAP2, Length 515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SPX	Q9BT56	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RBKS	Q9H477	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC17A3	O00476	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SDC2	P34741	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RAB11A	P62491	216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A087WYN8	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GPX1	P07203	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR4E1	P0C645	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CCR6	P51684	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q6ZQT7	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PITX3	O75364	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IL5	P05113	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRSS1	P07477	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR5G3	P0C626	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MXD1	Q05195	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRR9	Q5T870	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NIT1	Q86X76	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CIDEA	O60543	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR10J4	P0C629	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00869	P0C866	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SELENOT	P62341	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ERCC8	Q13216	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RHOH	Q15669	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	VCX	Q9H320	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		H3BQ15	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		H3BTX0	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TAAR5	O14804	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	ZNF253	O75346	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AKR1C4	P17516	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		Q0VG73	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	GUK1	Q16774	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NRAC	Q8N912	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		A0A0B4J2A0	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		K7EPK0	472 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658		M0R2P5	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	CCS	O14618	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAB3GAP2-208	ENST00000484658	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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