RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GAGE12BA1L429 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 RGS13O14921 159 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GAGE7O76087 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GAGE12FP0CL80 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GAGE12GP0CL81 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GAGE12IP0CL82 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 P0DMU3 169 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FAM231AP0DMU4 169 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FAM231CP0DMU5 169 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ZNF345Q14585 488 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.45□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 A0A0D9SG52 128 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TCRAP04437 139 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TVP23CQ96ET8 276 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SGK494Q96LW2 274 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 EPDR1Q9UM22 224 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.44□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 KMT2AQ03164 3969 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PRE2 83 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GGTLC3B5MD39 225 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TCL1AP56279 114 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 OR5I1Q13606 314 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 MUC21Q5SSG8 566 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 Q6AWC8 147 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZTI0 123 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TREM1Q9NP99 234 aa6.43□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 K7EQM0 130 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 BCL2L11O43521 198 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SPINK4O60575 86 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 NUDT3O95989 172 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 SEC11BP0C7V7 166 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FHITP49789 147 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 UBE2G2P60604 165 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZNX1 250 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMUB2Q71RG4 321 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 MDFICQ9P1T7 246 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 PSG8Q9UQ74 426 aa6.42□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FAM74A7A6NL05 159 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 F6UZH7 168 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 GNRH2O43555 120 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 IFNA7P01567 189 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 IGLV2-11P01706 119 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 HOXA5P20719 270 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ZNF415Q09FC8 603 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 RNF212Q495C1 297 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 PRNTQ86SH4 94 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 LINC00479Q96M42 142 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 C18orf15Q96N68 181 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ATG101Q9BSB4 218 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 NAGKQ9UJ70 344 aa6.41□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 A0A0J9YY99 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 UMAD1C9J7I0 102 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 PFDN1O60925 122 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TDRG1Q3Y452 100 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 STOML3Q8TAV4 291 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 C8orf49Q96NF6 230 aa6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SYN3-211ENST00000472027 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.39□□□□□ -1.39
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