RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q6ZTC4	211 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYST	Q99698	3801 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RYR3	Q15413	4870 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550		H3BQ15	152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550		H3BTX0	84 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	GPX1	P07203	203 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	HTN3	P15516	51 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	M6PR	P20645	277 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SERF2	P84101	59 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	AGRN	O00468	2067 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550		A8MTW9	85 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TAAR5	O14804	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATP5G1	P05496	136 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	NMB	P08949	121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10J4	P0C629	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PYY	P10082	97 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATP5G3	P48201	142 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	FCN2	Q15485	313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	C7orf71	A4D174	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC17A3	O00476	420 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF138	P52744	262 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RYR2	Q92736	4967 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550		F5H768	121 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550		M0R3E3	92 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	CXorf1	O96002	111 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SH3BGR-208	ENST00000452550	PPT1	P50897	306 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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