RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	GLMP	Q8WWB7	406 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	TRGV3	P03979	118 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	AKAP6	Q13023	2319 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	CACNG7	P62955	275 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	TNFRSF6B	O95407	300 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGF1	P05019	195 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	CCL25	O15444	150 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	FGF6	P10767	208 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	ARL3	P36405	182 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2V1	Q13404	147 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	BRI3	O95415	125 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	C16orf92	Q96LL3	132 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	TAX1BP3	O14907	124 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	FOXE3	Q13461	319 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	PTTG1IP	P53801	180 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	C20orf173	Q96LM9	149 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFA4	O00483	81 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV12-3	P01733	135 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	FCER1G	P30273	86 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	GPHB5	Q86YW7	130 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	SNAI2	O43623	268 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGHG2	P01859	326 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	EVI2A	P22794	236 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZQT7	251 aa		12.91	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058		H3BUA1	57 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFS8	O00217	210 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	CCL19	Q99731	98 aa		12.9	□□□□□ -0.34
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058		A6NDX4	124 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	LEP	P41159	167 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	PRR9	Q5T870	116 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058		Q8N8P6	123 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	SOCS3	O14543	225 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.89	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	CD5L	O43866	347 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	LY6E	Q16553	131 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	NRAC	Q8N912	160 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058		H3BUX3	64 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	ZMAT4	Q9H898	229 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	OVOL1	O14753	267 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	ODF1	Q14990	250 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	KLK15	Q9H2R5	256 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058		H3BVH4	76 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	SIVA1	O15304	175 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	VAMP3	Q15836	100 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV1-40	P01703	118 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-11	P01762	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	MSMB	P08118	114 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	ATP5J2	P56134	94 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	BLCAP	P62952	87 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	SEC11A	P67812	179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058	PF4V1	P10720	104 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZS46	218 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058	ERAS	Q7Z444	233 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TOM1-210	ENST00000449058	CBY3	A6NI87	242 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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