RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617346.4

RPL17-222, Transcript of ribosomal protein L17, human

TSL 5

Gene RPL17, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL17-222	ENST00000617346	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	PIGP	P57054	158 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	AMTN	Q6UX39	209 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346		Q8N1X5	172 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	FAM210B	Q96KR6	192 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	NRN1	Q9NPD7	142 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346		A8MTW9	85 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	PSG1	P11464	419 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	HTN3	P15516	51 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ELOB	Q15370	118 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SSX7	Q7RTT5	188 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	C20orf202	A1L168	122 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	CORT	O00230	105 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	TOMM40	O96008	361 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	RD3L	P0DJH9	198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	GZMB	P10144	247 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	NPY1R	P25929	384 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	CEBPG	P53567	150 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	C2orf83	Q53S99	150 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ISOC2	Q96AB3	205 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	GPR146	Q96CH1	333 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	RFNG	Q9Y644	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346		H3BQ15	152 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346		K7EP13	123 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	CDS2	O95674	445 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	IFNA1	P01562	189 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF90	Q03938	601 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346		Q8WTZ3	238 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	PRO1933	Q9H354	126 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	GPR132	Q9UNW8	380 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346		A0A0J9YX75	114 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	TMEM189	A5PLL7	270 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	IFITM10	A6NMD0	228 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	AKR1C4	P17516	323 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	AZU1	P20160	251 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	G0S2	P27469	103 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	PAX9	P55771	341 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	NMS	Q5H8A3	153 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	FAM78B	Q5VT40	261 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPL17-222	ENST00000617346	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	AGPAT2	O15120	278 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	TRGC2	P03986	189 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	7.21	□□□□□ -1.26	7e-22	■■■■■ 34.6
RPL17-222	ENST00000617346	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	SRPX	P78539	464 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	IL15RA	Q13261	267 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	C6orf223	Q8N319	242 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPL17-222	ENST00000617346	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.21	□□□□□ -1.26

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