RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		9.68	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	HMSD	A8MTL9	139 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	IGLC2	P0DOY2	106 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	LCN15	Q6UWW0	184 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	SSX7	Q7RTT5	188 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		9.67	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468		H3BQ15	152 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	HTN1	P15515	57 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	RAB31	Q13636	194 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		9.66	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468		H3BNG1	76 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	M6PR	P20645	277 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	KIR3DS1	Q14943	382 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	TTC32	Q5I0X7	151 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	UPK3B	Q9BT76	320 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468		Q9H3A6	140 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468		Q9H8V8	135 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		9.65	□□□□□ -0.86
MUC1-222	ENST00000610468	PRAC2	D3DTV9	90 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SLC17A3	O00476	420 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZRG5	221 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ODF3	Q96PU9	254 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PPQ1	181 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ARPC5	O15511	151 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	COX7A2P2	O60397	106 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFB4	O95168	129 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	HOXA5	P20719	270 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V0C	P27449	155 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF345	Q14585	488 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	PFDN5	Q99471	154 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	IFNA5	P01569	189 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	OR5I1	Q13606	314 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N1X5	172 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	RAB2A	P61019	212 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF266	Q14584	549 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GUK1	Q16774	197 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ESRG	Q1W209	222 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	FXYD5	Q96DB9	178 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	FUT9	Q9Y231	359 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0J9YY99	117 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE12B	A1L429	117 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468		H3BTX0	84 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE7	O76087	117 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE12F	P0CL80	117 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE12G	P0CL81	117 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE12I	P0CL82	117 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	CT45A10	P0DMU9	189 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	PYY	P10082	97 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	C18orf15	Q96N68	181 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SNURFL	B1AK76	121 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	TAAR5	O14804	337 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	RGS13	O14921	159 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF253	O75346	499 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	LEP	P41159	167 aa		9.59	□□□□□ -0.87
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-2	P60368	255 aa		9.59	□□□□□ -0.87

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