RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 C7orf71A4D174 169 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 DEFB130BP0DP73 79 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 DEFB130AP0DP74 79 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 AZU1P20160 251 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 RAB2AP61019 212 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 KIR3DS1Q14943 382 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 FAM210BQ96KR6 192 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 Q9H3A6 140 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.54□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 SNURFLB1AK76 121 aa9.53□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 MBP02144 154 aa9.53□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 GPX1P07203 203 aa9.53□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.53□□□□□ -0.88
SENP3-209ENST00000610454 P0DMU3 169 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 FAM231AP0DMU4 169 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 FAM231CP0DMU5 169 aa9.52□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 Q5BKY6 102 aa9.52□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 RXFP4Q8TDU9 374 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ZNF503Q96F45 646 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 HYLS1Q96M11 299 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 VGLL1Q99990 258 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.52□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 RBAKDNA6NC62 111 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ATP5G1P05496 136 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 NMBP08949 121 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ATP5G3P48201 142 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ZNF138P52744 262 aa9.51□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 OTORQ9NRC9 128 aa9.51□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.5□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 RNF222A6NCQ9 220 aa9.5□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.5□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 Q8TAT8 98 aa9.5□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 F5H768 121 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ARPC5O15511 151 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 CD300CQ08708 224 aa9.49□□□□□ -0.89
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SENP3-209ENST00000610454 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 RAB24Q969Q5 203 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.49□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 TAAR5O14804 337 aa9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 CXorf1O96002 111 aa9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 STAG3L2P0CL84 134 aa9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 STAG3L3P0CL85 134 aa9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.48□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GAGE12BA1L429 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 K7EQM0 130 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GAGE7O76087 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GAGE12FP0CL80 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GAGE12GP0CL81 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GAGE12IP0CL82 117 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GCHFRP30047 84 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.47□□□□□ -0.89
SENP3-209ENST00000610454 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.46□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.46□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 TMED6Q8WW62 240 aa9.46□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.46□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.45□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.45□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.45□□□□□ -0.9
SENP3-209ENST00000610454 NUDT3O95989 172 aa9.45□□□□□ -0.9
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