RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 NEU1Q99519 415 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 VGLL1Q99990 258 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.9□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PFDN1O60925 122 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CXorf1O96002 111 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 STAG3L2P0CL84 134 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 STAG3L3P0CL85 134 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 AZU1P20160 251 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 GCHFRP30047 84 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPOP30536 169 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 LEPP41159 167 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 RRN3P1Q2M238 152 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SSX7Q7RTT5 188 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CELA1Q9UNI1 258 aa4.89□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 DIRC3C9JPN6 131 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL2L11O43521 198 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 GPX1P07203 203 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF138P52744 262 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CD300CQ08708 224 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF345Q14585 488 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF726P1Q15940 193 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 OTORQ9NRC9 128 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF492Q9P255 531 aa4.88□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM189A5PLL7 270 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C1QBP02746 253 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC11BP0C7V7 166 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 FHITP49789 147 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TAS2R60P59551 318 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2G2P60604 165 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 GNG5P63218 68 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 BTN1A1Q13410 526 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf74Q32Q52 190 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZQT7 251 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 Q6ZTC4 211 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP14Q86UN6 197 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SUN5Q8TC36 379 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SGK494Q96LW2 274 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C7orf71A4D174 169 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 RBAKDNA6NC62 111 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 NUPR2A6NF83 97 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLL5B9A064 214 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 H7BYZ3 331 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 HTN3P15516 51 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8TAT8 98 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TMED6Q8WW62 240 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 ODF3Q96PU9 254 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 DKK2Q9UBU2 259 aa4.86□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GV50 99 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 KLLNB2CW77 178 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf94C9JXX5 98 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNA7P01567 189 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 NMBP08949 121 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB130BP0DP73 79 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB130AP0DP74 79 aa4.85□□□□□ -1.63
EFTUD2-211ENST00000588374 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 182.9 ms