RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL26	Q96S19	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASCL2	Q99929	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANK2	Q01484	3957 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL2	P10415	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMP	P49913	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUK1	Q16774	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		F6UB75	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7EQG2	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q9H3A6	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGP	A6NDG6	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	HBE1	P02100	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLL1	P15814	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFPI2	P48307	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMB3	P49720	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS2R45	P59539	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB14	P61106	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERCC8	Q13216	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZQT7	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PRE2	83 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PS18	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0QZ24	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF253	O75346	499 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAP30	O75446	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD7	P09564	240 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALR1	P47211	349 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	VGLL1	Q99990	258 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RABGGTB-212	ENST00000491266	SORL1	Q92673	2214 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms