RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9H3A6	140 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	APLN	Q9ULZ1	77 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	GCHFR	P30047	84 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF503	Q96F45	646 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.41	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GVG6	124 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	PGP	A6NDG6	321 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	INS	P01308	110 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	LEP	P41159	167 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZTC4	211 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC51B	Q86UW2	128 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.4	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLL5	B9A064	214 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R3E3	92 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKN1B	P46527	198 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.39	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EQM0	130 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	HBE1	P02100	147 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB5C	P51148	216 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		12.38	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	RBAKDN	A6NC62	111 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX46	H3BTG2	121 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R2Z0	102 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	KMT2A	Q03164	3969 aa		12.37	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.36	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRE2	83 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	DIRC3	C9JPN6	131 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	CT45A10	P0DMU9	189 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC8	Q13216	396 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		12.35	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	NMB	P08949	121 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	PPT1	P50897	306 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF138	P52744	262 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01587	Q99440	93 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		12.34	□□□□□ -0.43
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA7	P01567	189 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX1	P07203	203 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424		P0DMU3	169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM231A	P0DMU4	169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM231C	P0DMU5	169 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300C	Q08708	224 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX7	Q7RTT5	188 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.33	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	LYRM9	A8MSI8	78 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	VGLL1	Q99990	258 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF492	Q9P255	531 aa		12.32	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424		F6UZH7	168 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424		H7BYZ3	331 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424		J3KRW8	73 aa		12.31	□□□□□ -0.44
HDAC10-216	ENST00000489424	FHIT	P49789	147 aa		12.31	□□□□□ -0.44

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