RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT1C4O75897 302 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CD2P06729 351 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLC6P0CF74 106 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 AKR1D1P51857 326 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 NABP2Q9BQ15 211 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 BRWD1Q9NSI6 2320 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 DISP2A7MBM2 1401 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf67F2Z3F1 127 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN19P0C672 248 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00694P0DN24 101 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-9P26371 169 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMF1Q92530 271 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNA1BQ00975 2339 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 GLI2P10070 1586 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 STRCP1A6NGW2 1772 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 K7ERU9 68 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCL8P10145 99 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DRB4P13762 266 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8TAT8 98 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 LPAR5Q9H1C0 372 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 ERG28Q9UKR5 140 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CUX1P39880 1505 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 PIEZO1Q92508 2521 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 COL4A5P29400 1685 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL4P13236 92 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KDELR1P24390 212 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 NCS1P62166 190 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS25P62851 125 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CST11Q9H112 138 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TNS3Q68CZ2 1445 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 DOCK10Q96BY6 2186 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf170A2RU37 121 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC160A6NGH7 325 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 HYPMO75409 117 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB13P59910 316 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX261Q6UWH6 196 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TEN1Q86WV5 123 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 MYLKQ15746 1914 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAMO43451 1857 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL9LQ86UU0 1499 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 PCBD1P61457 104 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB103AP81534 67 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 GKN2Q86XP6 184 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AS1Q8N127 324 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4C6Q8NH72 309 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 REG4Q9BYZ8 158 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 CPS1P31327 1500 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCY10Q96PN6 1610 aa2.71□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 ALKQ9UM73 1620 aa2.71□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 SZT2Q5T011 3432 aa2.71□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 GBF1Q92538 1859 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 TPST1O60507 370 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 NCR2O95944 276 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 CD14P08571 375 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 CKS2P33552 79 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 ETV6P41212 452 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB132Q7Z7B7 95 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.71□□□□□ -1.98
RABGGTB-209ENST00000473406 RFX7Q2KHR2 1363 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms