RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469770.1

ABCB4-209, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 746 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-209	ENST00000469770	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ARPC5	O15511	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	MPDU1	O75352	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	CD5	P06127	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	S100A7	P31151	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TFPI2	P48307	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PLP1	P60201	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	DEFA6	Q01524	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RIG	Q13278	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	HELT	A6NFD8	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770		K7EQG2	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	B2M	P61769	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770		K7EIL1	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TAAR5	O14804	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	CD7	P09564	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	CD300C	Q08708	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ZNF266	Q14584	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RASL10A	Q92737	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PFDN5	Q99471	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770		A0A0D9SG52	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770		H3BRN7	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	CXCL2	P19875	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	GALR1	P47211	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	GPR82	Q96P67	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	PFDN1	O60925	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	C1QB	P02746	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ID1	P41134	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ZNF345	Q14585	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	STH	Q8IWL8	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	JPT2	Q9H910	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB4-209	ENST00000469770	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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