RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	MUC21	Q5SSG8	566 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	ERCC8	Q13216	396 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058		H0Y8G0	127 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	PAX8	Q06710	450 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	TWIST1	Q15672	202 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	PRORY	Q9H606	182 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	NCR2	O95944	276 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	ORM1	P02763	201 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058		U3KQE9	123 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	CKS2	P33552	79 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	NPY	P01303	97 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	METTL26	Q96S19	204 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.02	□□□□□ -0.32
TOM1-210	ENST00000449058	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	RNF185	Q96GF1	192 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.02	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	MPV17L2	Q567V2	206 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.01	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	HBD	P02042	147 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	GNLY	P22749	145 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	ITPR1	Q14643	2758 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	PPBP	P02775	128 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		13	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV1-69	P01742	117 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	DPF1	Q92782	380 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	LINC01546	A6NGU7	62 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	TCF21	O43680	179 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	COX8A	P10176	69 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZVH6	145 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	CACNA1B	Q00975	2339 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT3	O95989	172 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	FXYD7	P58549	80 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	GAS8-AS1	O95177	125 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TOM1-210	ENST00000449058	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms