RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 S100A2P29034 98 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 CAMPP49913 170 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 RASL11AQ6T310 242 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SMPXQ9UHP9 88 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GXF2 115 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 K7EMT4 169 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DQA1P01909 254 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 PRR31Q5SQ13 230 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 OR10D4PQ8NGN7 298 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.6□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 APCSP02743 223 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 TMEM86BQ8N661 226 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.59□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 FAM231BA6NCW3 169 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SOCS3O14543 225 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 NUPR1O60356 82 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 CRISP2P16562 243 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SLAQ13239 276 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WW49 117 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 RNF152Q8N8N0 203 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.58□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 FAM181BA6NEQ2 426 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 SRD5A1P18405 259 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ACANP16112 2415 aa13.57□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMEM189A5PLL7 270 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 F2Z2F3 143 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 AMBPP02760 352 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 SMIM6P0DI80 62 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 HBBP68871 147 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF738Q8NE65 137 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 NRN1Q9NPD7 142 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ESM1Q9NQ30 184 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.56□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 DEFB1P60022 68 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZSV7 163 aa13.55□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TMEM213A2RRL7 107 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 SRIP30626 198 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 BMI1P35226 326 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF138P52744 262 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 SYNJ2BPP57105 145 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 LINC00310P59036 64 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 A8MWP6 167 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 Q0VG73 95 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TPPP3Q9BW30 176 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 FASNP49327 2511 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 HAX1O00165 279 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 BAGE3Q86Y29 109 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.52□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 DEFB136Q30KP8 78 aa13.52□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 PYY3Q5JQD4 70 aa13.52□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13.52□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 ZNF575Q86XF7 245 aa13.52□□□□□ -0.24
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GUT8 65 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 SERF1AO75920 110 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 REC114Q7Z4M0 266 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 OVOL1O14753 267 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 ORM1P02763 201 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 SMR3AQ99954 134 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 AKAP9Q99996 3911 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 F6UB75 175 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 LGALS9O00182 355 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 SLURP1P55000 103 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 SSTP61278 116 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 RIGQ13278 110 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 IQCJQ1A5X6 159 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.5□□□□□ -0.25
ACTB-201ENST00000331789 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.5□□□□□ -0.25
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