RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 C11orf52Q96A22 123 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 C17orf77Q96MU5 243 aa11.95□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.95□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 FXYD5Q96DB9 178 aa11.95□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.94□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 ZNF329Q86UD4 541 aa11.94□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 C2orf70A6NJV1 201 aa11.93□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 LINC00311Q8N616 119 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 TEX22C9J3V5 150 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 C9JCJ5 164 aa11.92□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 FSTL3O95633 263 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 APCSP02743 223 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.92□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PRE2 83 aa11.91□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 SSX8Q7RTT4 187 aa11.91□□□□□ -0.5
CTIF-205ENST00000587860 RNF183Q96D59 192 aa11.91□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 PSG8Q9UQ74 426 aa11.9□□□□□ -0.5
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CTIF-205ENST00000587860 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.9□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 ZNF137PP52743 207 aa11.9□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 KIR3DS1Q14943 382 aa11.9□□□□□ -0.51
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CTIF-205ENST00000587860 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.9□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.9□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.89□□□□□ -0.51
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CTIF-205ENST00000587860 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 TEX45Q8NA69 505 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 B5MCH6 92 aa11.88□□□□□ -0.51
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CTIF-205ENST00000587860 CX3CL1P78423 397 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 MTURNQ8N3F0 131 aa11.88□□□□□ -0.51
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CTIF-205ENST00000587860 EPDR1Q9UM22 224 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 M0R3E3 92 aa11.88□□□□□ -0.51
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CTIF-205ENST00000587860 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.87□□□□□ -0.51
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CTIF-205ENST00000587860 NUP35Q8NFH5 326 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 LRRK2Q5S007 2527 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 H3BRM9 83 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 TSPAN13O95857 204 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1-17P01599 117 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 NDPQ00604 133 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 WFDC2Q14508 124 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 PRNTQ86SH4 94 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 YAE1D1Q9NRH1 226 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-205ENST00000587860 KLRB1Q12918 225 aa11.87□□□□□ -0.51
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