RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563220.1

COMMD4-208, Transcript of COMM domain containing 4, human

TSL 2

Gene COMMD4, Length 1,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COMMD4-208	ENST00000563220	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.78	□□□□□ -0.2
COMMD4-208	ENST00000563220	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.78	□□□□□ -0.2
COMMD4-208	ENST00000563220	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
COMMD4-208	ENST00000563220	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.78	□□□□□ -0.2
COMMD4-208	ENST00000563220	NF1	P21359	2839 aa		13.77	□□□□□ -0.2
COMMD4-208	ENST00000563220	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.77	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.77	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.77	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220		A0A087WW49	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	TYMS	P04818	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	PSG9	Q00887	426 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	OR5I1	Q13606	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	IMMP2L	Q96T52	175 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	ZNF253	O75346	499 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	EDN2	P20800	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	BAGE2	Q86Y30	109 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	BTF3L4	Q96K17	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220		K7EMT4	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	HLA-DMB	P28068	263 aa		13.75	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	UBE2G1	P62253	170 aa		13.75	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	SFRP2	Q96HF1	295 aa		13.75	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	DIRC3	C9JPN6	131 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	GCG	P01275	180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.74	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220		A0A1W2PS18	150 aa		13.73	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.73	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	PYY3	Q5JQD4	70 aa		13.73	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	CHEK1	O14757	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	SYNJ2BP	P57105	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	LTA	P01374	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	MLST8	Q9BVC4	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	LINC00587	B1AMM8	73 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	CSN1S1	P47710	185 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	FOXL1	Q12952	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
COMMD4-208	ENST00000563220	CD28	P10747	220 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	LGALS9	O00182	355 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	PSG3	Q16557	428 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220		Q86TA4	180 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	ASCL2	Q99929	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.7	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	NDUFA7	O95182	113 aa		13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	SLURP1	P55000	103 aa		13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.69	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220		A8MWP6	167 aa		13.68	□□□□□ -0.22
COMMD4-208	ENST00000563220	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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