RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 FAM223BA6NKX1 122 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 CRIP1P50238 77 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 CAMPP49913 170 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 RIGQ13278 110 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC140Q96MF4 163 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1B0GUT8 65 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 PIFOQ8TCI5 191 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 COL12A1Q99715 3063 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 H3BUA1 57 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 BUB3O43684 328 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 CT45A10P0DMU9 189 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 U3KQE9 123 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRF-212ENST00000477970 IGHG4P01861 327 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 ECSCRQ19T08 205 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 M0R3E3 92 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CHEK1O14757 476 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV3-23P01764 117 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 PMCHP20382 165 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 RNF114Q9Y508 228 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 ABCA4P78363 2273 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGF1P05019 195 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 GPR183P32249 361 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 PRR25Q96S07 402 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 DSCR9P59020 149 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 BORCS7Q96B45 105 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 HSBP1O75506 76 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC3BP05452 202 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 VAMP8Q9BV40 100 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF580Q9UK33 172 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 C3orf79P0CE67 100 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 LRBAP50851 2863 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 BMI1P35226 326 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CTRLP40313 264 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf49Q96NF6 230 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 M0QZK8 103 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 KRTDAPP60985 99 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 ATP5G2Q06055 141 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 PMCHL1Q16048 86 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 SH2D1AO60880 128 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM189A5PLL7 270 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01548A6NM66 108 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 G3V318 75 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 OR5AL1P0C617 328 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CD33P20138 364 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 GATA3P23771 443 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 KRTAP10-9P60411 292 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 U3KQK5 164 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 PDZD2O15018 2839 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 C20orf202A1L168 122 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 A6NDX4 124 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRF-212ENST00000477970 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 LCN12Q6JVE5 192 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 METTL26Q96S19 204 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 C2orf70A6NJV1 201 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 FBN2P35556 2912 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGHG2P01859 326 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 MSMBP08118 114 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 USMG5Q96IX5 58 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 CNFNQ9BYD5 112 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00614P0C842 121 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 IGLC6P0CF74 106 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRF-212ENST00000477970 FOXC2Q99958 501 aa9.41□□□□□ -0.9
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