RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4S1Q8NGB4 309 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB37Q96AX2 223 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AC2Q9NZP5 309 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 NHSL1Q5SYE7 1610 aa2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 IFT140Q96RY7 1462 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
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RABGGTB-209ENST00000473406 M0R2Z0 102 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.84□□□□□ -1.95
RABGGTB-209ENST00000473406 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
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RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 MUCL1Q96DR8 90 aa2.83□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM135BQ49AJ0 1406 aa2.83□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 BCORL1Q5H9F3 1711 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 F8W036 122 aa2.82□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGXB3Q12766 1538 aa2.82□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 GLYATL3Q5SZD4 288 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 ARPINQ7Z6K5 226 aa2.8□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 TANC2Q9HCD6 1990 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0556O60303 1618 aa2.79□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 OVOS2Q6IE36 1432 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 ERC2-IT1O76042 136 aa2.79□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 BLCAPP62952 87 aa2.79□□□□□ -1.96
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RABGGTB-209ENST00000473406 MED12LQ86YW9 2145 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A4P12235 298 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 MMGT1Q8N4V1 131 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 COL6A3P12111 3177 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-209ENST00000473406 FANCD2Q9BXW9 1451 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 RGS12O14924 1447 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EP13 123 aa2.77□□□□□ -1.97
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