RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 FAM25AB3EWG3 89 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 FAM25CB3EWG5 89 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 FAM25GB3EWG6 89 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PRSS46E5RG02 174 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 K7EQD1 137 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 HPGDSO60760 199 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 FHL2Q14192 279 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PXDC1Q5TGL8 231 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 MZT2AQ6P582 158 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 C8orf49Q96NF6 230 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PRRT1Q99946 306 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 RS1O15537 224 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PITX3O75364 302 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 LINC00869P0C866 280 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 CT45A10P0DMU9 189 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 SLC25A6P12236 298 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TEPPQ6URK8 271 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TM2D2Q9BX73 214 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 RNF213Q63HN8 5207 aa9.99□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 C7orf71A4D174 169 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 J3KRW8 73 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 IGHV3-53P01767 116 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 IAPPP10997 89 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TIRAPP58753 221 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.98□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 E5RGE8 158 aa9.97□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 MORN5Q5VZ52 161 aa9.97□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PRAC2D3DTV9 90 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SYNGR2O43760 224 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 MPDU1O75352 247 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 GYPEP15421 78 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SCXQ7RTU7 201 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 AP3S1Q92572 193 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 ARL6Q9H0F7 186 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 ARV1Q9H2C2 271 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 KLLNB2CW77 178 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 C9JCJ5 164 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 K7EPK0 472 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 NMBP08949 121 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 AKAIN1P0CW23 69 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 GUK1Q16774 197 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 YIPF6Q96EC8 236 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 LINC00477Q96M19 166 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 PRR13Q9NZ81 148 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.95□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SMCO3A2RU48 225 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 WRBO00258 174 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 TNFSF8P32971 234 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 LAGE3Q14657 143 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 PATE2Q6UY27 113 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 RGS13O14921 159 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1G2O95670 118 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 BLNKQ8WV28 456 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 FNDC10F2Z333 226 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 IGLV2-8P01709 118 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 Q9HAA7 133 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 ZNF253O75346 499 aa9.91□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 GPX1P07203 203 aa9.91□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 IGLC2P0DOY2 106 aa9.91□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.91□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 SLC17A3O00476 420 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 GOSR2O14653 212 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-204ENST00000436289 CRISP2P16562 243 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms