RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM213A2RRL7 107 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 GCGP01275 180 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 FOLR2P14207 255 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 AWAT1Q58HT5 328 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 TCF24Q7RTU0 167 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01551Q86U37 167 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00477Q96M19 166 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 F8P00451 2351 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 LTAP01374 205 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 ADIRFQ15847 76 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 CENPWQ5EE01 88 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 ISOC2Q96AB3 205 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 RAX2Q96IS3 184 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 OSTCQ9NRP0 149 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 BTN1A1Q13410 526 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 DERL1Q9BUN8 251 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 MLST8Q9BVC4 326 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 PSG8Q9UQ74 426 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 H3BTX0 84 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 H7BYZ3 331 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SLC17A3O00476 420 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SOCS3O14543 225 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 CSN3P07498 182 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 S100PP25815 95 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SLURP1P55000 103 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SFRP2Q96HF1 295 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF492Q9P255 531 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 K7EQG2 157 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV2-11P01706 119 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV2-8P01709 118 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 INSL3P51460 131 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 ERVFC1-1P60608 527 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 GNG5P63218 68 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 RNF212Q495C1 297 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 DCANP1Q8TF63 244 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00479Q96M42 142 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 FAM231BA6NCW3 169 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C46A6NHA9 309 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 M0R3E3 92 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 CT45A10P0DMU9 189 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF138P52744 262 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB136Q30KP8 78 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 CT83Q5H943 113 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 PRNTQ86SH4 94 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF738Q8NE65 137 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 PRR25Q96S07 402 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 ASCL2Q99929 193 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 CITED1Q99966 193 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PRX2 142 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-211ENST00000425989 XKRY2A2RUG3 117 aa7.24□□□□□ -1.25
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