RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 SYNGR2O43760 224 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 MED6O75586 246 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 LEPP41159 167 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 Q8N814 137 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ST6GAL2Q96JF0 529 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 PSCAO43653 123 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA3P12429 323 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SRPXP78539 464 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 FHL2Q14192 279 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF680Q8NEM1 530 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ARV1Q9H2C2 271 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD12-201ENST00000404162 C1QBP02746 253 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 CRYGDP07320 174 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ODF3Q96PU9 254 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 TCL1AP56279 114 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SELENOTP62341 195 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SLAQ13239 276 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM4Q8WVI0 70 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 AP3S1Q92572 193 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SCGB3A2Q96PL1 93 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 E5RGE8 158 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A6P12236 298 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZSA8 131 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 S100A7AQ86SG5 101 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 C7orf71A4D174 169 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 K7EQD1 137 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 OXTP01178 125 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 BTN1A1Q13410 526 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00305Q7Z4B0 112 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WXM4 84 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V1G2O95670 118 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SRIP30626 198 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 CD300CQ08708 224 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 VGLL1Q99990 258 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 H3BQ15 152 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 CCNKO75909 580 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ERCC8Q13216 396 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 MORN5Q5VZ52 161 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 LRTM2Q8N967 370 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 RNF24Q9Y225 148 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 PXMP4Q9Y6I8 212 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXD12-201ENST00000404162 CTDSP2O14595 271 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 IGLC2P0DOY2 106 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF415Q09FC8 603 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 MCUBQ9NWR8 336 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RABL2BQ9UNT1 228 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 KLLNB2CW77 178 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RGS5O15539 181 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 GYPEP15421 78 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 RNF213Q63HN8 5207 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 K7EPK0 472 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CTDSPLO15194 276 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 MPDU1O75352 247 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 HOXB5P09067 269 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 SFTA3P0C7M3 94 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OPCMLQ14982 345 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 C4orf46Q504U0 113 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZQT7 251 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM37Q8WXS4 190 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FAM19A4Q96LR4 140 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 Q9HAA7 133 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PSENENQ9NZ42 101 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 IL18Q14116 193 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 WFDC2Q14508 124 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF479Q96JC4 524 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 M0R3E3 92 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 OR4E1P0C645 316 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 VAMP1P23763 118 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD12-201ENST00000404162 CTF1Q16619 201 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms