RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 RPRMQ9NS64 109 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 HSPB11Q9Y547 144 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 B2MP61769 119 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 RRN3P1Q2M238 152 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 FAM78BQ5VT40 261 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZRG5 221 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 ASB13Q8WXK3 278 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 MBD2Q9UBB5 411 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 F6UB75 175 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 FCN2Q15485 313 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 LCN15Q6UWW0 184 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 ATP5SQ99766 215 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 ATG101Q9BSB4 218 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 H3BQ15 152 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 ZNF253O75346 499 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 CLINT1Q14677 625 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 RGS21Q2M5E4 152 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 RNF182Q8N6D2 247 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 THAP6Q8TBB0 222 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PKD1P98161 4303 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 C16orf90A8MZG2 172 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 SLC17A3O00476 420 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PSG3Q16557 428 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 GUK1Q16774 197 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 MED28Q9H204 178 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 NACAE9PAV3 2078 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 INSP01308 110 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 AQP10Q96PS8 301 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 WFDC1Q9HC57 220 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 LYRM9A8MSI8 78 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 G3V3Q6 166 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 CDK2AP2O75956 126 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 NDUFB4O95168 129 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 FGL1Q08830 312 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 PDE6HQ13956 83 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 DEFB130BP0DP73 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 DEFB130AP0DP74 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 TNP2Q05952 138 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 Q5BKY6 102 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ZNF738Q8NE65 137 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 F5H768 121 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 M0R2Z0 102 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 NUDT3O95989 172 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 CCL18P55774 89 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 C6orf223Q8N319 242 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ZNF503Q96F45 646 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 FUT9Q9Y231 359 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 RNF222A6NCQ9 220 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 PRAC2D3DTV9 90 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 H3BTX0 84 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 IFNA5P01569 189 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 PYYP10082 97 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 TSPOP30536 169 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-204ENST00000403441 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms