RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 ATP5G3P48201 142 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 MEOX2P50222 304 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 PAFAH1B2P68402 229 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 DCANP1Q8TF63 244 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SOCS3O14543 225 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 MRAPQ8TCY5 172 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 H3BTX0 84 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 K7EIL1 84 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 K7EQG2 157 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 PDE6HQ13956 83 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 BLNKQ8WV28 456 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 OR4C46A6NHA9 309 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF253O75346 499 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFB4O95168 129 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 TFPI2P48307 235 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SLC17A3O00476 420 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF727A8MUV8 499 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 C11orf52Q96A22 123 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 C16orf92Q96LL3 132 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 PARLQ9H300 379 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 GGTLC3B5MD39 225 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 ISLRO14498 428 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 CD7P09564 240 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 TVP23CQ96ET8 276 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXD11-201ENST00000249504 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 RANP62826 216 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PSG9Q00887 426 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 M0R036 132 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 ID1P41134 155 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 OTORQ9NRC9 128 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 NAT8Q9UHE5 227 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 Q8N1Y9 231 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 Q9H3A6 140 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PGPA6NDG6 321 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 OR11H12B2RN74 326 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF688P0C7X2 276 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 HLA-DMBP28068 263 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 RHEBQ15382 184 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 RNF182Q8N6D2 247 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 C20orf173Q96LM9 149 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PSG3Q16557 428 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 EPDR1Q9UM22 224 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 B4DEV8 164 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PEX7O00628 323 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 AKR1C3P42330 323 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PSMG4Q5JS54 123 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB125Q8N687 156 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 TUBA4BQ9H853 241 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 PRELID1Q9Y255 219 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.46□□□□□ -0.1
HOXD11-201ENST00000249504 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
HOXD11-201ENST00000249504 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.46□□□□□ -0.1
HOXD11-201ENST00000249504 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.46□□□□□ -0.1
HOXD11-201ENST00000249504 C9JCJ5 164 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXD11-201ENST00000249504 M0R3E3 92 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111 ms