RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 SAP30O75446 220 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGC2P03986 189 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 FHITP49789 147 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 SSX7Q7RTT5 188 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM210BQ96KR6 192 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV1-17P01599 117 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGLC1P0CG04 106 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF727A8MUV8 499 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 K7EMT4 169 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 RARRES2Q99969 163 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf70A6NJV1 201 aa8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 ARL16Q0P5N6 197 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TM4SF20Q53R12 229 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM18Q96B42 140 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TRGV9Q99603 122 aa8.05□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 HBG1P69891 147 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 HBG2P69892 147 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-205ENST00000450873 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5I1Q13606 314 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 SMPXQ9UHP9 88 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.02□□□□□ -1.13
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