RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 SMCO1Q147U7 214 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 RBKSQ9H477 322 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 FAM30AQ9NZY2 134 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 RAB26Q9ULW5 256 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.1□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 AKR1C4P17516 323 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 RAP2BP61225 183 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 RPP30P78346 268 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 Q8N814 137 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.09□□□□□ -0.79
NELFE-204ENST00000436289 CXCL2P19875 107 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 C4orf46Q504U0 113 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZSA8 131 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 COMMD3Q9UBI1 195 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 FUT9Q9Y231 359 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.08□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 A0A0B4J2A0 478 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 H3BRN7 92 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 CRYGDP07320 174 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 TAS2R19P59542 299 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 CCDC190Q86UF4 302 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 LRTM2Q8N967 370 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ST6GAL2Q96JF0 529 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.07□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 HYPMO75409 117 aa10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 RAB3DO95716 219 aa10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ODF3Q96PU9 254 aa10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.06□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 LEPP41159 167 aa10.05□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 CRYBA4P53673 196 aa10.05□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 KIR3DS1Q14943 382 aa10.05□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 TDRG1Q3Y452 100 aa10.05□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SPINK4O60575 86 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 MED6O75586 246 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SRIP30626 198 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 PLP1P60201 277 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 LCN15Q6UWW0 184 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 OR4D10Q8NGI6 311 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 GPR132Q9UNW8 380 aa10.04□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 PRAF2O60831 178 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 IL5P05113 134 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SELENOTP62341 195 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SRPXP78539 464 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ZNF415Q09FC8 603 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ASAH1Q13510 395 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 OR52I2Q8NH67 350 aa10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
NELFE-204ENST00000436289 DISC1C4P0D8 188 aa10.02□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 AKR1C1Q04828 323 aa10.02□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.02□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 VGLL1Q99990 258 aa10.02□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 ORM1P02763 201 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 OR5G3P0C626 314 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 ANXA3P12429 323 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TGFBR1P36897 503 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TCL1AP56279 114 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 NEDD8Q15843 81 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.01□□□□□ -0.81
NELFE-204ENST00000436289 Q9H521 79 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms