RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 S100A7P31151 101 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 BCAP31P51572 246 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 A0A087X0K7 114 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 E5RGE8 158 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 IGKV3-20P01619 116 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 GALR1P47211 349 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 HBG1P69891 147 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 HBG2P69892 147 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 OPCMLQ14982 345 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ATP6V1FQ16864 119 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 STX12Q86Y82 276 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ARV1Q9H2C2 271 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 MUC4Q99102 2169 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 MPC2O95563 127 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ID1P41134 155 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 CAMLGP49069 296 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RAP2BP61225 183 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 BAXQ07812 192 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 LINC00052Q96N35 136 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 UHRF2Q96PU4 802 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ARL6Q9H0F7 186 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A22Q9H936 323 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 DOK5Q9P104 306 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ALG5Q9Y673 324 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 DNAH2Q9P225 4427 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SSNA1O43805 119 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 MPDU1O75352 247 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RLN2P04090 185 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 HTN3P15516 51 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 FXYD7P58549 80 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 NHLH2Q02577 135 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RNF212Q495C1 297 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZR54 194 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 S100A7AQ86SG5 101 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 C20orf173Q96LM9 149 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 DKK2Q9UBU2 259 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RNF24Q9Y225 148 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.79□□□□□ -1
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PRAME-204ENST00000403441 OXA1LQ15070 435 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 MORN5Q5VZ52 161 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 ZNF709Q8N972 641 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-204ENST00000403441 RSG1Q9BU20 258 aa8.78□□□□□ -1
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PRAME-204ENST00000403441 IGLC2P0DOY2 106 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 CXCL2P19875 107 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 DEFB1P60022 68 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 RAB31Q13636 194 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 MIC13Q5XKP0 118 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 ZNF575Q86XF7 245 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PFDN5Q99471 154 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.77□□□□□ -1.01
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PRAME-204ENST00000403441 COX7A2P2O60397 106 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 FGF7P21781 194 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 DAD1P61803 113 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 PSG9Q00887 426 aa8.76□□□□□ -1.01
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PRAME-204ENST00000403441 AMTNQ6UX39 209 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 C16orf92Q96LL3 132 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-204ENST00000403441 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.76□□□□□ -1.01
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