RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289672.6

PKD1L1-201, Transcript of polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1L1, Length 9,092 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L1-201ENST00000289672 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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PKD1L1-201ENST00000289672 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 NBL1P41271 181 aa7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 LINC01560Q8TB33 94 aa7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 SPSB2Q99619 263 aa7.18□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 COLCA2A8K830 154 aa7.17□□□□□ -1.26
PKD1L1-201ENST00000289672 Q0VG73 95 aa7.17□□□□□ -1.26
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