RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524		Q6ZTC4	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	C7orf66	A4D0T2	115 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	IGLL5	B9A064	214 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	LINC00869	P0C866	280 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	C20orf173	Q96LM9	149 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	DOK5	Q9P104	306 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	DEDD	O75618	318 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	CCNK	O75909	580 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A087X0K7	114 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524		F6UB75	175 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	AMBP	P02760	352 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5G3	P0C626	314 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	FXYD7	P58549	80 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF546	Q86UE3	836 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524		L7N2F9	121 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	GOSR2	O14653	212 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	VAMP2	P63027	116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	C2orf50	Q96LR7	162 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	AGPAT2	O15120	278 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	CXCL2	P19875	107 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	B2M	P61769	119 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	FGL1	Q08830	312 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	OXA1L	Q15070	435 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	CCS	O14618	274 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	HBE1	P02100	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	CXCL3	P19876	107 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PRR20E	P86478	221 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PRR20C	P86479	221 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PRR20D	P86480	221 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PRR20B	P86481	221 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	PRR20A	P86496	221 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	IL15RA	Q13261	267 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	RAB31	Q13636	194 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
KIFC3-208	ENST00000561524	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
KIFC3-208	ENST00000561524	BCAP31	P51572	246 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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