RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 HOXB5P09067 269 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 DEFB130BP0DP73 79 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 DEFB130AP0DP74 79 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 S100A7P31151 101 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 TNFSF8P32971 234 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF575Q86XF7 245 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 RNF182Q8N6D2 247 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-205ENST00000549039 SYNGR2O43760 224 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 NUDT3O95989 172 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 HTN1P15515 57 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 AP3S2P59780 193 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 PYDC2Q56P42 97 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF738Q8NE65 137 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.58□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 LYRM9A8MSI8 78 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 F5H768 121 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A6P12236 298 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TMBIM6P55061 237 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 RAP2BP61225 183 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 RHOBP62745 196 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 FCN2Q15485 313 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 AMTNQ6UX39 209 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 BAP18Q8IXM2 172 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 MCFD2Q8NI22 146 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR82Q96P67 336 aa8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SFT2D2O95562 160 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 IL5P05113 134 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 B2MP61769 119 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R1AQ13522 171 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 LRTM2Q8N967 370 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 C17orf77Q96MU5 243 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC01587Q99440 93 aa8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 HSPG2P98160 4391 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 PRSS46E5RG02 174 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 OR5G3P0C626 314 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 AZU1P20160 251 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SOSTQ9BQB4 213 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.55□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 A8MTW9 85 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 C16orf90A8MZG2 172 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 H3BMQ9 156 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 HYPMO75409 117 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 ATP5G1P05496 136 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00869P0C866 280 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 ATP5G3P48201 142 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 CCL18P55774 89 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TRIM63Q969Q1 353 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 UHRF2Q96PU4 802 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 PSENENQ9NZ42 101 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 H3BRN7 92 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SSSCA1O60232 199 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAP1O75689 374 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TSPOP30536 169 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TNP2Q05952 138 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 CLINT1Q14677 625 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.53□□□□□ -1.04
CTDSP2-205ENST00000549039 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 S100A5P33763 92 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 TAS2R60P59551 318 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 S100A7AQ86SG5 101 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 C6orf223Q8N319 242 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 C16orf74Q96GX8 76 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 ARL6Q9H0F7 186 aa8.52□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC160A6NGH7 325 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 CBY3A6NI87 242 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 SCGB1D2O95969 90 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDSP2-205ENST00000549039 CXCL3P19876 107 aa8.51□□□□□ -1.05
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