RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K OPT2Q06593 877 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR078CQ06813 372 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K AAD4Q07747 329 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR012CQ07927 99 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM39Q08223 395 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K APC5Q08683 685 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PER33Q12144 273 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.73□□□□□ -1.97not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K BI3Q9ZZW7 517 aa2.73□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HIS1P00498 297 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K LEU1P07264 779 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SST2P11972 698 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC63P14906 663 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K CYC8P14922 966 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ATE1P16639 503 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K DAL81P21657 970 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SPT5P27692 1063 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K PMI40P29952 429 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SPC110P32380 944 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN12P32496 274 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL050CP35736 922 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K DCW1P36091 449 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K NCL1P38205 684 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K OCA5P38738 679 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR078WP38799 552 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K LAM1P38851 1228 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K BAT1P38891 393 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K EXO1P39875 702 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K STL1P39932 569 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K KTR7P40504 517 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL054WP40524 105 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM23P47015 356 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K COG7P53195 279 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RSC1P53236 928 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SNO2P53823 222 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ESBP6P53918 673 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YAT1P80235 687 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HAP5Q02516 242 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K UFO1Q04511 668 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K HPF1Q05164 967 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K LCB5Q06147 687 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K YFT2Q06676 274 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG10Q07879 167 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K OPI10Q08202 246 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO21Q12411 609 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K VPS5Q92331 675 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K FMP27Q06179 2628 aa2.72□□□□□ -1.97
tW(CCA)KtW(CCA)K COX3P00420 269 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RED1P14291 827 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PUT4P15380 627 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO12P17123 173 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CLC1P17891 233 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SLX5P32828 619 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PXA2P34230 853 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ADD66P36040 267 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PXL1P36166 706 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL40P36534 297 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K RRP3P38712 501 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA3P38758 523 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K CRP1P38845 465 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K FAA3P39002 694 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM9P39551 298 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TMN3P40071 706 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K KHA1P40309 873 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PAN6P40459 309 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data2.71□□□□□ -1.98not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K NBP35P52920 328 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM14P53109 570 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR127WP53275 312 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TIM13P53299 105 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K VAC7P53950 1165 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PIR1Q03178 341 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR444WQ04093 687 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K AIM32Q04689 311 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR222WQ04925 415 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K THI21Q08975 551 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG9Q12142 997 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR046CQ12253 270 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX11Q12462 236 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K NAG1Q8TGN9 163 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K AFI1Q99222 893 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K ENO1P00924 437 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K PYC1P11154 1178 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K TRM1P15565 570 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(CCA)KtW(CCA)K MIH1P23748 554 aa2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms