RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	PIC2	P40035	300 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.22	□□□□□ -1.57	not detected
TRM10	YOL093W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	ESBP6	P53918	673 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	UME1	Q03010	460 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	ECM7	Q06200	448 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	SDH5	Q08230	162 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	SUT2	Q12286	268 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.22	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	LAA1	P39526	2014 aa		5.21	□□□□□ -1.57
TRM10	YOL093W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	PET123	P17558	318 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ERC1	P38767	581 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SPC72	P39723	622 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	LCB2	P40970	561 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	HFM1	P51979	1187 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	VPS72	Q03388	795 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	VPS60	Q03390	229 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	TRS130	Q03660	1102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SHS1	Q07657	551 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	APL4	Q12028	832 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	FUB1	P25659	250 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	KIP1	P28742	1111 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	CBF2	P32504	956 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YEL043W	P32618	956 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	TMT1	P32643	299 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	NDC80	P40460	691 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	LAM5	P43560	674 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	IES1	P43579	692 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	FMP30	Q02883	468 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SAM35	P14693	329 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SPO12	P17123	173 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	BCS1	P32839	456 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	MRX3	P38172	270 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	AIM21	P40563	679 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YFL040W	P43562	540 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YJL045W	P47052	634 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	MSE1	P48525	536 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ORC5	P50874	479 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YGR021W	P53212	290 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	JJJ1	P53863	590 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
TRM10	YOL093W	SIW14	P53965	281 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YMR018W	Q04364	514 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	OSH2	Q12451	1283 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	PET111	P08468	800 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	CKI1	P20485	582 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YSC84	P32793	468 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	UIP5	P36137	443 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	CCZ1	P38273	704 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	AZR1	P50080	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SCS3	P53012	380 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ERV41	Q04651	352 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	YLR455W	Q06188	304 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	DAS2	Q12084	232 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	SLX4	Q12098	748 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	GIS3	Q12418	502 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	GLN3	P18494	730 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	DRE2	P36152	348 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TRM10	YOL093W	ALG3	P38179	458 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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