RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W IFA38P38286 347 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YGL260WP53056 76 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HFD1Q04458 532 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HDA3Q06623 655 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YDL218WQ07629 317 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FRE7Q12333 620 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SRO9P25567 434 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MCM5P29496 775 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MRP4P32902 394 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W XRS2P33301 854 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PSY2P40164 858 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GYP7P48365 746 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPA14P50106 137 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TFB2Q02939 513 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RTT10Q08924 1013 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W LAG2Q92325 660 aa3.08□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MET2P08465 486 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ELO2P25358 347 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PEX6P33760 1030 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W DUG2P38149 878 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UFE1P41834 346 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SWS2P53937 143 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W DAL4Q04895 635 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TMS1Q12116 473 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W DAT1P13483 248 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PRK1P40494 810 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CNN1P43618 361 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YHC3P47040 408 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YGL140CP53120 1219 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PEX8P53248 589 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UGO1Q03327 502 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W BSP1Q06604 576 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PDR18P53756 1333 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CDC34P14682 295 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W OM45P16547 393 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PEX1P24004 1043 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W EAP1P36041 632 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SAP190P36123 1033 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MRPL15P36523 253 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YBR062CP38239 180 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ATG14P38270 344 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MBP1P39678 833 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SET4P42948 560 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W IRC8P47046 822 aa3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YEL1P34225 687 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W EMC3P36039 253 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HSE1P38753 452 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PNG1Q02890 363 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PTC5Q12511 572 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W VPS5Q92331 675 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TMA108P40462 946 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W BSC2Q05611 235 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YCS4Q06156 1176 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.06□□□□□ -1.92not detected
SIN3YOL004W SFG1Q12507 346 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PRO3P32263 286 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W BEM4P39011 633 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YDL186WP48568 277 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TOF1P53840 1238 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TRM82Q03774 444 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TPP1Q03796 238 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W NTG2Q08214 380 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YOR378WQ08902 515 aa3.06□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FPR1P20081 114 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SIR1P21691 654 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
SIN3YOL004W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W INM2Q05533 292 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YLR030WQ07967 263 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TUP1P16649 713 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W COQ1P18900 473 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W REC107P21651 314 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SNT1P25357 1226 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PTP2P29461 750 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FUN30P31380 1131 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CYS4P32582 507 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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