RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C SPO1P53541 631 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C CPR8P53728 308 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ECM9Q02202 377 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YHM2Q04013 314 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C IRC3Q06683 689 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YDL121CQ07541 149 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YPR027CQ12079 277 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa2.79□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C GAL1P04385 528 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C SER1P33330 395 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C DUN1P39009 513 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C PIP2P52960 996 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YGL117WP53133 265 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C SPC105P53148 917 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C UBX4P54730 416 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C MFM1Q02783 413 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ARG7Q04728 441 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C YPL216WQ08964 1102 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C ZPS1Q12512 249 aa2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
YFR056CYFR056C STE4P18851 423 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C COX11P19516 300 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C IME1P21190 360 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C MRPL9P31334 269 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C DID4P36108 232 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C HXT7P39004 570 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C IES5P40060 125 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C BUD8P41698 603 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C MPS1P54199 764 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C STP1Q00947 519 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YPS7Q06325 596 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YDL073WQ07454 984 aa2.77□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C SWI6P09959 803 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C APA1P16550 321 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C DPB3P27344 201 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C PTP2P29461 750 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C OAF3P36023 863 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.76□□□□□ -1.97not detected
YFR056CYFR056C PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C TAF4P50105 388 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YIP4P53093 235 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YGR021WP53212 290 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C ATP23P53722 227 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C FDC1Q03034 503 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C SKY1Q03656 742 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C MLC2Q06580 163 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C PEX15Q08215 383 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C HFI1Q12060 488 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C APM4Q99186 491 aa2.76□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C MBR1P23493 339 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C SEC65P29478 273 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C PRE4P30657 266 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YKL133CP36066 463 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C FAT1P38225 669 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YEL025CP39991 1188 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C SCS3P53012 380 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C SLD3P53135 668 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C STP4Q07351 490 aa2.75□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C PMA2P19657 947 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C RPC34P32910 317 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C MRPL7P36519 292 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C EXO84P38261 753 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data2.74□□□□□ -1.97not detected
YFR056CYFR056C FTR1P40088 404 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C HIS6P40545 261 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YJL043WP47053 257 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C COQ6P53318 479 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C BUD17P53727 317 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C TIM50Q02776 476 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C NSE5Q03718 556 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C AIM41Q12032 185 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C TGS1Q12052 315 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C NKP1Q12493 238 aa2.74□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C YMR084WA2P2R3 262 aa2.73□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C WHI2P12611 486 aa2.73□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
YFR056CYFR056C TUP1P16649 713 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.1 ms