RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 GABRQQ9UN88 632 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFB123Q8N688 67 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 INPP5BP32019 993 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FCGRTP55899 365 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FLIIQ13045 1269 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOOK2Q96ED9 719 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 MOGSQ13724 837 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCAF15Q66K64 600 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 Q7L0L9 218 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM83AQ86UY5 434 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 WWC1Q8IX03 1113 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 ADCY3O60266 1144 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 BCRP11274 1271 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBE4AQ14139 1066 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR153Q6NV75 609 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 TEKT1Q969V4 418 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 DEFB118Q96PH6 123 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.17■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-209ENST00000616395 NEFLP07196 543 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 ELNP15502 786 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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TRAPPC3-209ENST00000616395 CYP2C8P10632 490 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 BMP8BP34820 402 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC27Q2M243 656 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 FLT3LGP49771 235 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC3-209ENST00000616395 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.12■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAPN2P17655 700 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 VPS37DQ86XT2 251 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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TRAPPC3-209ENST00000616395 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 BCAMP50895 628 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRIQ9BWK5 157 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALPK3Q96L96 1907 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 IRF5Q13568 498 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 BEND3Q5T5X7 828 aa22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 F6X3S4 739 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM151AQ8WW52 585 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC3-209ENST00000616395 CXCL11O14625 94 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCP10Q12799 353 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL16Q14005 1332 aa22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRM8O00222 908 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYN1P17600 705 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAST3O60307 1309 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 TDHQ8IZJ6 230 aa22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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