RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ECM29Q5VYK3 1845 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMB1P07942 1786 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-206ENST00000588815 PLCG2P16885 1265 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 HSCBQ8IWL3 235 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 NAPBQ9H115 298 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKBIEO00221 500 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK4P51957 841 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 YDJCA8MPS7 323 aa36.93■■■■□ 3.5
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CAPNS1-206ENST00000588815 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 DIXDC1Q155Q3 683 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNRF3Q9ULT6 936 aa36.93■■■■□ 3.5
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CAPNS1-206ENST00000588815 NAV1Q8NEY1 1877 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF213O14771 459 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 MCM2P49736 904 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D2Q9BYX2 928 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TIAM2Q8IVF5 1701 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 HHIPL2Q6UWX4 724 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 JDP2Q8WYK2 163 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNQ5Q9NR82 932 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 CASTP20810 708 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCK5Q3MIX3 580 aa36.9■■■■□ 3.5
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CAPNS1-206ENST00000588815 SBF1O95248 1867 aa36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAB2O43741 272 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TDO2P48775 406 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT17Q9BSW7 474 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 RUFY3Q7L099 469 aa36.88■■■■□ 3.5
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH1P12882 1939 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 BTDP43251 543 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TEKT1Q969V4 418 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK1Q96PY6 1258 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 VIL1P09327 827 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SDR42E1Q8WUS8 393 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 E7EWF7 191 aa36.85■■■■□ 3.49
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CAPNS1-206ENST00000588815 MXD3Q9BW11 206 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC14Q96N46 770 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF6LQ9Y6J9 622 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 F8W031 263 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA10Q9UK55 444 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ANAPC4Q9UJX5 808 aa36.82■■■■□ 3.49
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CAPNS1-206ENST00000588815 HAND2P61296 217 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 STOX1Q6ZVD7 989 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.82■■■■□ 3.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD14O00487 310 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CRKP46108 304 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP14P50281 582 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 USP5P45974 858 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 SBK1Q52WX2 424 aa36.8■■■■□ 3.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 PDRG1Q9NUG6 133 aa36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD17O75943 681 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 RHBDL3P58872 404 aa36.79■■■■□ 3.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 TEX11Q8IYF3 940 aa36.78■■■■□ 3.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
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CAPNS1-206ENST00000588815 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 AMOTL1Q8IY63 956 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 STAG1Q8WVM7 1258 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF3Q9H094 633 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR19Q8NEZ3 1342 aa36.76■■■■□ 3.47
CAPNS1-206ENST00000588815 AKNAD1Q5T1N1 836 aa36.75■■■■□ 3.47
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CAPNS1-206ENST00000588815 FZD9O00144 591 aa36.74■■■■□ 3.47
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