RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587969.1

GIPC1-209, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene GIPC1, Length 484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-209ENST00000587969 SRGAP3O43295 1099 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 TRIM27P14373 513 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 TIMM10P62072 90 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CRHR2Q13324 411 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.67□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CCDC102BQ68D86 513 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 MIER1Q8N108 512 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 EFCC1Q9HA90 598 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CSADQ9Y600 493 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.66□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 SEMA3EO15041 775 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 SP3Q02447 781 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 TCP10Q12799 353 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 TFCP2Q12800 502 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 MTX1Q13505 466 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 OTUD5Q96G74 571 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.65□□□□□ -0.06
GIPC1-209ENST00000587969 PTPRFP10586 1907 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 A0A1B0GUL7 405 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 FAM151AQ8WW52 585 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 XAGE2Q96GT9 111 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 WRNIP1Q96S55 665 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 USP40Q9NVE5 1235 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.64□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 DOCK1Q14185 1865 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 GNAI2P04899 355 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 GTF2A2P52657 109 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 NFIAQ12857 509 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 RASGRF1Q13972 1273 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 CCL15Q16663 113 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 DCAF15Q66K64 600 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 HOOK2Q96ED9 719 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 MGAMO43451 1857 aa14.63□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZBTB22O15209 634 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 INPP5BP32019 993 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ARHGEF6Q15052 776 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ERO1BQ86YB8 467 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZNF333Q96JL9 665 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.62□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 CAP1Q01518 475 aa14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ABCF2Q9UG63 623 aa14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 CENPFP49454 3210 aa14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 GAKO14976 1311 aa14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 FOCADQ5VW36 1801 aa14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 IRF6O14896 467 aa14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 PPIL2Q13356 520 aa14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.6□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 BRCA2P51587 3418 aa14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 CETPP11597 493 aa14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 RGS3P49796 1198 aa14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 NBPF11Q86T75 865 aa14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.59□□□□□ -0.07
GIPC1-209ENST00000587969 BTBD19C9JJ37 291 aa14.58□□□□□ -0.08
GIPC1-209ENST00000587969 PPATQ06203 517 aa14.58□□□□□ -0.08
GIPC1-209ENST00000587969 SNAPC2Q13487 334 aa14.58□□□□□ -0.08
GIPC1-209ENST00000587969 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.58□□□□□ -0.08
GIPC1-209ENST00000587969 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
GIPC1-209ENST00000587969 PI16Q6UXB8 463 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms