RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 PLCG2P16885 1265 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 FOCADQ5VW36 1801 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 LCORLQ8N3X6 602 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 ARMT1Q9H993 441 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 BTDP43251 543 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 MAP4K1Q92918 833 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 USP26Q9BXU7 913 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP100Q494V2 611 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 RRAGCQ9HB90 399 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 WDR90Q96KV7 1748 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 RHBDL3P58872 404 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 PTH1RQ03431 593 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 GLTPD2A6NH11 291 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 FOXP2O15409 715 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 ALX1Q15699 326 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 VPS53Q5VIR6 699 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-210ENST00000568388 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 DLGAP5Q15398 846 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 MICALL2Q8IY33 904 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 CEP350Q5VT06 3117 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 ZMYM6O95789 1325 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 H7C1D1 291 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 SPDYE6P0CI01 402 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 USP40Q9NVE5 1235 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 SCN4AP35499 1836 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 PRKAB2O43741 272 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 MYH1P12882 1939 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 SHTN1A0MZ66 631 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 NECTIN1Q15223 517 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 TEX11Q8IYF3 940 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 FGAP02671 866 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 APPP05067 770 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 IDI2Q9BXS1 227 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 LAMA4Q16363 1823 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 WNT10BO00744 389 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 HSPA4P34932 840 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 KCNB2Q92953 911 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 MCCP23508 829 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 EPS15P42566 896 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 USP5P45974 858 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-210ENST00000568388 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-210ENST00000568388 POTECB2RU33 542 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-210ENST00000568388 MYO1BO43795 1136 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-210ENST00000568388 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms