RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539982.5

CLSTN3-209, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-209ENST00000539982 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.7□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.7□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.69□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 ALDH1L1O75891 902 aa14.69□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.69□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 RNF208Q9H0X6 261 aa14.69□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 MYPNQ86TC9 1320 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 DLL1O00548 723 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 INPP5BP32019 993 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 UBXN2AP68543 259 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.68□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 FAM151AQ8WW52 585 aa14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 KAZALD1Q96I82 304 aa14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 MAST3O60307 1309 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 A0A1W2PPC1 479 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 PDE8BO95263 885 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 FCGRTP55899 365 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 MOGSQ13724 837 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 WDR63Q8IWG1 891 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SUCLG2Q96I99 432 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.66□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SGPL1O95470 568 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 CAPN2P17655 700 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 BCAMP50895 628 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 PRKCZQ05513 592 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 LRRC24Q50LG9 513 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 METTL24Q5JXM2 366 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLSTN3-209ENST00000539982 CXCL11O14625 94 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 BCRP11274 1271 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 CCDC184Q52MB2 194 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.64□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 EVI5O60447 810 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 CYP2C8P10632 490 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 GABRQQ9UN88 632 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 UTYO14607 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 ADCY3O60266 1144 aa14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 TCP10Q12799 353 aa14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 KIF16BQ96L93 1317 aa14.62□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 FGFR2P21802 821 aa14.61□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 FLT3LGP49771 235 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 NFIAQ12857 509 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 IRF5Q13568 498 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 STAP2Q9UGK3 403 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.6□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 MGAMO43451 1857 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 INHAP05111 366 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 ELNP15502 786 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 LRCH3Q96II8 777 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 DEFB118Q96PH6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 USP40Q9NVE5 1235 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 A0A0C4DFX4 3053 aa14.59□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 AK9Q5TCS8 1911 aa14.58□□□□□ -0.07
CLSTN3-209ENST00000539982 COL6A3P12111 3177 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 PTPRAP18433 802 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.7 ms