RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520400.5

CTNNA1-222, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 4

Gene CTNNA1, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-222	ENST00000520400	GJA8	P48165	433 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	AP3B2	Q13367	1082 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	KCNB2	Q92953	911 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	C8orf37	Q96NL8	207 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPON2	Q9BUD6	331 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	INPP5A	Q14642	412 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CTNNA1-222	ENST00000520400	ALX3	O95076	343 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	ARL4D	P49703	201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	PWP1	Q13610	501 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	WDR18	Q9BV38	432 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	CILP	O75339	1184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	CYP11A1	P05108	521 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	RLBP1	P12271	317 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRIM37	O94972	964 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	ELN	P15502	786 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	RAC1	P63000	192 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	AOC2	O75106	756 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	PDE3A	Q14432	1141 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRRC14	Q15048	493 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	GFRA2	O00451	464 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	DRD2	P14416	443 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	GSK3A	P49840	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	FGR	P09769	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	NTF4	P34130	210 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	GML	Q99445	158 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CTNNA1-222	ENST00000520400	KRBA1	A5PL33	1030 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	RING1	Q06587	406 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	REC114	Q7Z4M0	266 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	PODN	Q7Z5L7	613 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	DNAJA2	O60884	412 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	TIAF1	O95411	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	NOS3	P29474	1203 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	CLC	Q05315	142 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CTNNA1-222	ENST00000520400	MPP2	Q14168	576 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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